信息孤岛问题：各粮食局和分支机构之间没有形成统一的标准。数据之间没有流通，存在信息孤岛问题，同时原有的数据治理体系与技术达不到现阶段对粮食安全信息化的业务需求，出现业务管理水平低、数据管理力度弱等突出问题。

海量数据存储问题：基于原有的粮食数据系统，在进行数据交换过程中缺乏海量数据抽取、分析和处理能力，粮食流通行业基础数据库、上市主体数据库等数据库中的数据不够精确、无法存储全量数据，不能给数据共享部分与分析中心提供优质数据。

缺乏海量数据作为数据分析依据，当前的可视化技术图形化展示系统的手段比较单一，无法帮助管理者了解、把握全国、全省粮食库存情况。随着粮食产品、粮食交通、气象等数据容量和复杂性的与日俱增，大数据可视化的需求越来越大，现阶段的系统可视化平台达不到视频展示、分析的精确要求。尤其在GIS领域，基于传统系统的可视化手段数据分析不准确，不能实现从秘密麻麻、错综复杂的数据挖掘信息，无法使管理者对数据的空间分布模式、趋势、相关性和统计信息一目了然，影响决策的正确性。

架构存在局限性，基于原有的系统与技术已经不具备实现对粮食产量数据进行精准预测，以及粮食流通环节精准匹配，造成误判。影响对于物流调运、仓库配备、加工生产、销售出口等粮食流通领域的宏观调控和管理决策。